依據疾管署歷年監測資料顯示，臺灣日本腦炎流行季節為每年的5月至10月， 6月至7月為流行高峰期；而豬隻為日本腦炎病毒主要增幅宿主，並由三斑家蚊、環紋家蚊及白頭家蚊為媒介進行傳播，病媒蚊主要孳生於水稻田、池塘及灌溉溝渠等處。
豬隻日本腦炎以夏天初妊娠母豬最易感染發病，依據疾管署歷年監測資料顯示，臺灣日本腦炎流行季節為每年的5月至10月， 6月至7月為流行高峰期；而豬隻為日本腦炎病毒主要增幅宿主，並由三斑家蚊、環紋家蚊及白頭家蚊為媒介進行傳播，病媒蚊主要孳生於水稻田、池塘及灌溉溝渠等處。
豬除了是增幅宿主外，豬本身感染日本腦炎主要會造成繁殖障礙的問題，懷孕母豬感染後會導致流產及死產，可見產出大小不一的胎兒，有木乃伊胎、死胎、具神經症狀的弱小仔豬、或正常仔豬。而公豬感染則造成睪丸腫大，性慾減退，精液品質下降。公豬的影響多為暫時性，可恢復性，但若病情嚴重亦可導致永久性不育，對養豬農民造成經濟損失，因此，新母豬6月齡及配種前應各施打1劑日本腦炎疫苗，經產母豬每年應補強1劑；且養豬戶室內應加裝紗窗紗門、使用補蚊燈或驅蚊劑等防蚊方法，室外的溝渠、池溏、大型容器等積水處也該落實清理，以防病媒蚊孳生。
人感染日本腦炎病毒可能會出現發燒、頭痛、嘔吐、意識障礙甚至昏迷死亡，致死率達20-30％，存活者亦可能產生嚴重神經性後遺症，本所去(111)年度針對本縣養豬場周邊道路進行防疫消毒工作共計1907場次以降低畜牧場病媒蚊指數，阻斷本病感染人之途徑，
呼籲轄內養豬戶除了幫豬隻施打日本腦炎疫苗外，應每日觀察動物健康情形，倘發現可疑疫情時，應立即主動通報本所派員協助處理。